吉格斯太镇位于达拉特旗最东部，东南与准格尔旗接壤，西南与白泥井镇毗邻，北与包头市土右旗隔河相望。镇内地形南高北低，从南向北自然分为三个单元：南部为丘陵沟壑区，地势起伏较大，海拔1308-1149米;中部为库布其沙漠带，大部为流动或半流动沙丘，海拔1092-1129米;北部为黄河南岸平原，地势平坦，海拔高度为1000米。
镇机关所在地大红奎村，地理坐标为：北纬40°17′56″，东经110°32′49″，距旗政府所在地树林召镇50公里。镇内交通便捷，羊巴线横穿东西，德萨线纵贯南北，召圪梁浮桥直达包头市土右旗。境内地势南高北低倾斜而下，南部为鄂尔多斯高原缓坡地带，地势起伏不平;中部为库布其沙漠丘陵区，土壤属于沙化、半沙化状态;北部多为黄河冲积平原，地势平坦，土质肥沃，地下水资源丰富。
